의료공학과에서는 실무업무의 능력배양과 취업에 필요한 자격증 취득을 적국 권장 하고 있으며 주로 의료기술 관련분야, 의료행정/정보/임상관련분야, 전자/전기/정보통신 관련분야, 근골격계질환 관련분야의 자격증 취득이 가능하다.

의료기술 분야

• 의료공학 전문가 (의공산업기사 : 국가자격증)

의료행정/정보/임상 분야

• 병원 행정사
• 의료정보관리사
• 병원코디네이터
• 약국정보 관리사

전자/전기/정보통신 관련분야

• 전자/전기 산업기사
• 전자계산기조직 응용 산업기사
• 유/무선 설비 산업기사
• 정보처리산업기사

근골격계질환 분야

• 인간공학 기사(취업 2년후 가능)